All'inizio della sua attività, Alter Trade fu sostenuta da membri del movimento dei consumatori giapponese, e si occupava di mettere in contatto diretto i produttori di generi alimentari con i gruppi più poveri delle aree urbane. Alter Trade ha costituito negli anni altre strutture parallele, per far fronte alle necessità di lavorazione, di conversione biologica, di supporto ai produttori.
Attualmente Alter Trade si pone l'obiettivo di migliorare le proprie capacità commerciali e la qualità dei propri prodotti, rimanendo allo stesso tempo aderente ai valori di sostenibilità e collaborazione propri del commercio equo e solidale.

Alter Trade produce zucchero di canna biologico Mascobado, la varietà tipica delle Filippine, ottenuta estraendo il succo dalla canna e cristallizzandolo attraverso bolliture successive. Un particolare prodotto di Alter Trade è la banana verde: molto apprezzata dal mercato giapponese al quale è destinata, è diventata un simbolo dello sforzo congiunto di due Paesi verso un'economia sostenibile.
Alter Trade Corporation è affiancata da due organizzazioni omonime: Alter Trade Manufacturing Corporation e Alter Trade Foundation. La prima si occupa di acquistare e lavorare la canna da zucchero per ottenere il Mascobado; la Fondazione è invece dedicata al sostegno delle cooperative di contadini tramite servizi quali accesso al credito, formazione, sostegno tecnico.